建设工程合同纠纷处理流程：
1、严格招投标和承发包程序；
2、建设前期加强立项管理；
3、加强合同和信息管理；
4、严格进行工程变更把关；
5、加强隐蔽工程的检查验收；
6、及时解决工程中的索赔问题；
7、结算时，力争不漏算；
8、进一步规范业主、承包商、行政管理部门的行为。
一、项目经理在承担工程项目施工管理过程中履行哪些职责
（1）贯彻执行国家和工程所在地的有关法律、法规和，执行企业的各项管理制度；
（2）严格财务制度，加强财经管理，正确处理国家、企业与个人的利益关系；
（3）执行项目承包合同中由项目经理负责履行的各项条款；
（4）对工程项目施工进行有效控制，执行有关技术规范和标准，积极推广应用新技术，确保工程质量和工期，实现安全、文明生产，努力提高经济效益。
二、欠农民工工资新法规与新规定有何区别?
一是针对用工管理和工资支付行为不规范问题；二是针对一些企业工资支付主体责任难落实问题，要求健全工资支付监控和保障制度。三是完善企业守法诚信管理制度；四是针对建设领域市场秩序不规范问题，提出加强建设资金监管、规范工程款支付和结算行为、改革工程建设领域用工方式等措施，从源头上预防和减少拖欠工资问题。
三、工程结算价超过中标价怎么处理
工程结算价超过中标价的处理如下：
1、中标价是单价合同，工程量按实际发生确认，实际工程量比招标预计量高了1倍，会发生如上情况；
2、中标价是总价合同，施工中发生了重大的设计变更和合同约定以外的风险，照成了结算价高；
3、中标价是费率合同，实际发生量比招标预计量高，且材料价格上涨。
法律依据是合同约定对双方的契约规定。
工程结算是指施工企业按照承包合同和已完工程量向建设单位目标结算方式即在工程合同中，将承包工程的内容分解成不同的控制界面，以业主验收控制界面作为支付工程款的前提条件。也就是说，将合同中的工程内容分解成不同的验收单元，当施工单位完成单元工程内容并经业主经验收后，业主支付构成单元工程内容的工程价款。
在目标结算方式下，施工单位要想获得工程价款，必须按照合同约定的质量标准完成界面内的工程内容，要想尽早获得工程价款，施工单位必须充分发挥自己的组织实施能力，在保证质量的前提下，加快施工进度。工程结算。施工合同中的价格结算是由双方协商确定的，可以是想你说的这种一次性包死，也可以是约定工程变更的具体程序，单价标准等等，施工结束后在进行具体的结算。
【本文关联的相关法律依据】
《民法典》第七百八十
建设工程合同是承包人进行工程建设，发包人支付价款的合同。
建设工程合同包括工程勘察、设计、施工合同。
第七百八十九条
建设工程合同应当采用书面形式。
第七百九十条
建设工程的招标投标活动，应当依照有关法律的规定公开、公平、公正进行。
第七百九十一条
发包人可以与总承包人订立建设工程合同，也可以分别与勘察人、设计人、施工人订立勘察、设计、施工承包合同。发包人不得将应当由一个承包人完成的建设工程支解成若干部分发包给数个承包人。
