合作医疗报销是有时间的。
一般是需要在一年内进行报销的，不可以跨年度报销，农村合作医疗一年一缴纳，报销需要的材料包括门诊发泡，住院等。
一般新型农村合作医疗的报销时间是当年之内，如果花费的医疗费用跨年度的，则一般不超过一季度，具体则根据各地的相关规定来确定。
农合医疗报销需要材料：
1、门诊报销携带资料：门诊、合作医疗证历本（或病历）；
2、住院报销携带资料：住院、合作医疗证历本（或病历）、费用明细清单、出院小结、其它有关证明；
3、门诊特殊病报销携带资料：门诊、特殊病种合作医疗证历本；
4、办理特殊病种携带资料：特殊病种门诊治疗建议书，合作医疗证历本、病历、有关化验报告单、照片二张。
综上所述，合作医疗报销有时间，一般是三个月的时间。合作医疗，全称新型农村合作医疗保险，是在群众自愿互助的基础上，依靠集体经济，在防病治病上实行互济互助的一种福利性质的医疗制度。
【法律依据】：
《中华人民共和国社会保险法》第二十六条
职工基本医疗保险、新型农村合作医疗和城镇居民基本医疗保险的待遇标准按照国家规定执行。
第二十
符合基本医疗保险药品目录、诊疗项目、医疗服务设施标准以及急诊、抢救的医疗费用，按照国家规定从基本医疗保险基金中支付。
第二十九条
参保人员医疗费用中应当由基本医疗保险基金支付的部分，由社会保险经办机构与医疗机构、药品经营单位直接结算。
社会保险行政部门和卫生行政部门应当建立异地就医医疗费用结算制度，方便参保人员享受基本医疗保险待遇。
