残疾人注册公司特定情况下免税。大部分情况下是减少收取。残疾人领办独资企业或者是合伙企业的，登记费减半收取。从事图书、电子游戏、台球、录相、影碟出租等生产经营的，管理费免收。
另外，企业有残疾人申请免税，按照人头免税。
1、企业支付给残疾员工的工资可以从所得税中予以扣除，并且可以100%加计扣除，
2、、营业税：对安置残疾人的单位，实行由税务机关按单位实际安置残疾人的人数，限额即征即退的办法。实际安置的每位残疾人每年可退还的或减征的营业税的具体限额，由县级以上税务机关根据单位所在区县（含县级市）适用的经省级批准的最低工资标准的6倍确定，但最高不得超过每人每年3.5万元。
3、雇佣残疾员工达到规定比例，可以免缴残疾人就业保障金。各地还有一些富有地方特色的优惠，各企业还需具体和地方残联或地税咨询。
以上所提及的都是有关残疾人免税的一些法律知识，因着国家对残疾人方面的大力支持，所以我们应该相应国家的号召，帮助残疾人就业创业。
【本文所涉及的法律依据】：：
《中华人民共和国个人所得税法》
第五条
  有下列情形之一的，可以减征个人所得税，具体幅度和期限，由省、自治区、直辖市规定，并报同级人民代表大会常务委员会备案：
  （一）残疾、孤老人员和烈属的所得；
  （二）因自然灾害遭受重大损失的。
  可以规定其他减税情形，报全国人民代表大会常务委员会备案。
