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专利名称:确定检测靶点的方法、装置、计算机设备和存储介
质
专利类型:发明专利
发明人:孙亚洲,杜刘稳,陈斌,牛团结,肖贡,郭婷,曾柳眉,陈杰申请号:CN201810651693.9申请日:20180622公开号:CN110021365A公开日:20190716
摘要:本申请涉及一种确定检测靶点的方法、系统、计算机设备和存储介质。方法包括:确定待检测的目标病原体操作组;从靶点数据库中获取目标病原体操作组中包含的特异性k‑mer;确定目标病原体操作组中包含的每个基因组中包含的特异性k‑mer;对每个基因组包含的特异性k‑mer进行处理,得到每个基因组对应的非重合特异性区域集合;获取每个基因组对应的非重合特异性区域集合中包含的每个非重合特异性区域在全部非重合特异性区域集合中的出现次数;选取出现次数超过预设次数阈值的非重合特异性区域作为目标病原体操作组的检测靶点。这种技术方案大大扩大了潜在检测靶点的搜寻范围,增加了对检测靶点搜索范围限定的灵活性,提高了确定检测靶点的效率。
申请人:深圳市达仁基因科技有限公司
地址:518000 广东省深圳市前海深港合作区前湾一路1号A栋201室(入驻深圳市前海商务秘书有限公司)
国籍:CN
代理机构:广州华进联合专利商标代理有限公司
代理人:孙凯乐
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